Doi funcționari din perioada comunistă au revenit în funcție, după ce miniștrii liberali au plecat din Guvern. Executivul condus de Pavel Filip a aprobat noi viceminiștri la Educație, Mediu și Transport, precum și a numit alți directori la agențiile deținute anterior de reprezentanți ai Partidului Liberal.
După ieșirea liberalilor de la guvernare, în Guvernul Filip au fost numiți viceminiștri și șefi de agenții noi. Pavel Filip a spus că nu va propune alți minișitri, deoarece așteaptă votarea noii legi cu privire la Guvern. Noii viceminiștri propuși în funcție au rolul de a asigura funcționalitatea instituțiilor pe care le vor conduce.
Educația și Mediul, pe mâna foștilor comuniști
În locul celor trei liberali care și-au depus demisia din funcțiile deținute la Ministerul Mediului a venit în funcția de viceministru Ion Apostol. Acesta a fost în perioada 2007-2008 și din 2016 până în prezent director al Agenției Naționale de Reglementare a Activităților Nucleare și Radiologice. Ion Apostol a mai deținut funcția de viceministru al Ecologiei şi Resurselor Naturale în perioada 2008-2009 în Guvernul Grecianîi.
Viceministru al Educației a fost numită Lilia Pogolșa, care din 2008 până în prezent a fost director al Institutului de Științe ale Educației – structură a Ministerului Educaţiei și membru de profil al Academiei de Ştiinţe a Moldovei. Fostul ministru al Educației în guvernele Filat, Leancă și Gaburici, Maia Sandu, a spus despre Pogolșa că este incompetentă și a comis abuzuri în cadrul Institutului. Tentativa Maiei Sandu de a o demite pe Lilia Pogolșa din funcția de director a eșuat din cauza legislației muncii deficiente. Sandu mai spune că PD o promovează în funcție „pentru a distruge puținele lucruri bune de la minister” și afirmă că Pogolșa este cunoscută pentru „aversiunea acesteia față de limba și istoria românilor”. În perioada 2002-2003 Lilia Pogolșa a mai fost viceministru al Educației, fiind adjunctul ministrului Gheorghe Sima.
CITIȚI ȘI: Educația din Moldova în timpul comuniștilor. Milioane de lei irosiți pentru rescrierea istoriei sau mobilarea cabinetelor
În funcția de viceministru al Transporturilor și Infrastructurii Drumurilor a fost promovat Anatol Usatâi. Acesta a mai deținut această poziție în Guvernul Leancă, atunci când instituția a fost condusă de democratul Vasile Botnari, actual director al Moldovagaz.
În locul lui Octavian Apostol, la conducerea Agenția de Stat pentru Proprietate Intelectuală (AGEPI), a revenit Lilia Bolocan. Aceasta a fost șef al instituției în perioada 2009-2015, lucru remarcat de premierul Pavel Filip: „Cred că ați reușit să vi se facă dor de acest domeniu. Ați avut o pauză ca să vă încărcați cu energie”.
Adrian Cazacu a fost numit director al Agenţiei pentru Geologie şi Resurse Minerale, în locul liberalului Andrei Juraveli, iar Vitalie Bârsan a fost numit șef al Agenției Rezerve Materiale, înlocuindu-l pe Nicolae Hâncu.